В моей преподавательской карьере (преподаю историю, кандидат исторических наук) была ситуация одновременной работы в университете и институте, и вот что я вам скажу: разница между первым и вторым — просто огромная! Конечно, в пользу университета. Во-первых, это уровень ППС (профессорско-преподавательского состава): если в институте работают примерно 65-70% остепененных преподавателей, при этом подавляющее большинство из них — кандидаты наук, докторов мало, то в университетах — остепененность больше 90%, и докторов наук, как правило, больше, чем нас, кандидатов. Соответственно — уровень преподавания в университете несравненно выше!
Во-вторых, в университет идут, действительно лучшие студенты с баллом по ЕГЭ от 160-170 и выше, в то время, как в институт не только берут тех, кто набрал «сотню» по трем предметам. И при этом еще приманивают их, стипендиями, например, в том институте, где я работал (строительно-технологическом) их платили даже студентам, получавшим «тройки» по экзаменам!
Ну и в-третьих, общий уровень научно-преподавательской работы, да и подготовки, в университете значительно выше. Командировки, научно-практические конференции, написание и издание научных работ — все это в Университете котируется на значительно более профессионально-высоком уровне!
С другой стороны, если говорить про «минусы»: 1.Обучение в университете на порядок сложнее и стоит на коммерческом на порядок дороже и 2. В университете учат «всему», но порой менее глубоко в профессиональном плане, нежели в «профильных» институтах!